近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所（岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心）联合崖州湾国家实验室、山东省农业科学院湿地农业与生态研究所、中国水稻研究所等单位在《国家科学评论（National Science Review）》（IF=20.6）上在线发表了题为“Uncovering key salt-tolerant regulators through a combined eQTL and GWAS analysis using the super pan-genome in rice”的研究论文。研究绘制了水稻超级泛基因组群体在盐胁迫下的表达谱，并成功挖掘了新的水稻耐盐关键优异基因STG5，该研究对水稻耐盐育种改良具有重要意义。

盐碱地分布遍布全球30多个国家，面积约为9.5438亿公顷，其中我国盐碱地面积约9,913万公顷，位于世界第三，也是我国耕地重要的后备资源。如何唤醒这片“沉睡”土地，是当下亟需解决的“卡脖子”问题之一。

据介绍，盐胁迫会对水稻生长发育的各个阶段造成不同程度的危害，进而导致水稻产量降低。耐盐水稻的选育是盐碱地的开发利用重要举措。因此，深入对水稻不同种质资源进行耐盐性鉴定，并解析水稻耐盐优异等位基因和分子机制，可为耐盐水稻品种的培育奠定良好的理论基础和种质材料。

该研究构建了水稻超级泛基因组群体在正常和盐胁迫下的表达谱，系统分析了群体苗期耐盐性，评价多个耐盐性状指标，结合超级泛基因组的全基因组关联分析挖掘了多个耐盐新位点。研究鉴定到了一个耐盐主效基因STG5，研究发现，该基因可以显著提高日本晴品种的耐盐性，并主要参与调控Na+/K+稳态平衡，在耐盐生物育种中具有较大的应用潜力。该研究为耐盐基因挖掘提供了丰富的基因资源，将对研发和培育水稻耐盐新品种提供相关遗传资源和理论支持。

中国农业科学院深圳农业基因组研究所商连光研究员、崖州湾国家实验室钱前院士和山东省农业科学院湿地农业与生态研究所谢先芝研究员为论文的共同通讯作者。基因组所博士后魏华、汪贤猛、张志鹏和在读研究生杨龙波、张纤纤为论文共同第一作者。该研究得到国家自然科学基金基础科学中心、广东省自然科学基金杰出青年基金、中国农科院青年创新专项以及中国博士后基金和深圳市科技创新人才项目资金资助。

采写：南都记者 陈杏花